在废水微生物检测中，通常选择检测大肠杆菌的数量，主要是基于以下几个原因：
大肠杆菌被认为是人类和温血动物肠道中的常见细菌，通常作为粪便污染的指示生物。其存在表明废水中可能含有其他病原微生物，因此检测大肠杆菌的数量可以用来评估废水的卫生状况。
检测大肠杆菌的方法相对成熟且简单，常用的检测技术包括培养基法、膜过滤法和快速检测法等。这些方法通常具有较高的灵敏度和特异性，适合在不同实验室条件下进行。
许多国家和地区的水质标准中都规定了大肠杆菌的检测方法和限值，因此采用其作为监测指标可以使结果易于比较和标准化，有助于法规的遵循和环境管理。
大肠杆菌的存在与水传播疾病的风险密切相关，尤其是与粪便污染有关的疾病。因此，通过监测大肠杆菌的数量，能够间接评估废水对公共健康的潜在威胁。
相比检测其他病原体（如病毒、寄生虫等），检测大肠杆菌的成本较低，且所需时间较短，使得其成为监测废水微生物污染的经济实用选择。
大肠杆菌的数量可以帮助判断废水污染的来源，如农业、工业或市政污水，从而为污染治理提供依据。
尽管大肠杆菌是废水微生物检测中的重要指标，但在特定情况下，可能也需要检测其他病原微生物，尤其是在关注特定疾病传播风险时。因此，综合考虑多种微生物的检测可以更全面地评估废水的安全性和卫生状况。